Estudian la propagación interregional de dos bacterias resistentes a los antibióticos secuenciando su genoma completo

CIBER | miércoles, 27 de julio de 2022

Algunas enterobacterias son capaces de producir carbapenemasas, enzimas que degradan los antibióticos carbapenémicos., un grupo de antibióticos betalactámicos terapéuticos de última línea; es decir, se reservan para el tratamiento de infecciones que no son sensibles a otros antibióticos. La mayor incidencia de estas Enterobacteriaceae resistentes a carbapenémicos Constituye un problema de salud pública creciente a nivel internacional.

CARB-ES-19 es un estudio multicéntrico del Área de Enfermedades Infecciosas del CIBER (CIBERINFEC), publicado en Fronteras en Microbiologíaen el cual secuenciado el genoma completo de las Enterobacteriaceae productoras de carbapenemasas K. pneumoniae y E. coli, una amenaza para la salud pública en todo el mundo por su resistencia a los antibióticos y por ser causante de infecciones urinarias y sistémicas. Además, el estudio ha detectado la propagación de clones de alto riesgo en España

En este trabajo, coordinado por el director científico del CIBERINFEC Jesús Oteo e investigador del Centro Nacional de Microbiología del Instituto de Salud Carlos III, varios grupos del CIBER, el Instituto de Biomedicina de Sevilla (IBIS), el Instituto de Investigación Sanitaria Ramón and Cajal (IRYCIS), Instituto de Investigación Biomédica de A Coruña (INIBIC), Instituto Maimónides de Investigación Biomédica de Córdoba (IMIBIC), Hospital Universitario Vall d’Hebron, Fundación Institut d’Investigació Sanitària Illes Balears (IdISBa), Hospital Clinic de Barcelona y Hospital Universitario Marqués de Valdecilla (IDIVAL).

Un total de 71 hospitales españoles, representativos de todas las provincias españolas, han participado en CARB-ES-19, un proyecto de vigilancia de K. pneumoniae y E. coli productores de carbapenemasas para determinar su incidencia, distribución geográfica, filogenia y mecanismos de resistencia. Como explica Jesús Oteo“Este trabajo sirve como un primer paso hacia la integración de la secuenciación del genoma completo en la vigilancia de Enterobacteriaceae productoras de carbapenemasas en España, detectando importantes cambios epidemiológicos, entre ellos el aumento de la prevalencia e incidencia respecto a estudios previos, una amplia difusión interregional y una mayor difusión de clones de alto riesgo”.

En los hospitales, un total de 403 aislamientos de K. pneumoniae y E. coli. La prevalencia e incidencia se calcularon según denominadores poblacionales y la sensibilidad a los antibióticos se analizó por microdilución utilizando los criterios EUCAST (acrónimo en inglés del Comité Europeo que mide la susceptibilidad a los antimicrobianos). En total, 377 aislamientos de K. pneumoniae y 26 de E. coli, todos ellos resistentes al menos a un carbapenémico. Asimismo, la diseminación interregional de ocho clones de K. pneumoniae de alto riesgo, dos de ellos (ST512-258/KPC y ST15/OXA-48) responsables de la mayoría de las bacteriemias en este estudio.

Para Javier Cañada, investigador del Laboratorio de Referencia e Investigación en Resistencias a Antibióticos e Infecciones Relacionadas con la Salud del Centro Nacional de Microbiología (ISCIII), primer firmante del trabajo, “La incidencia general aumentó un 25% entre 2014 y 2019, con una amplia distribución geográfica, con cepas detectadas en el 92% de las 50 provincias españolas y presencia de siete clones de alto riesgo en al menos tres provincias”.

Los investigadores consideran que este estudio analiza la epidemiología de estas enterobacterias a través de la secuenciación genómica, “lo que supone un primer paso hacia la integración de este método en la vigilancia en España, ayudando al desarrollo de la Red de Laboratorios para la Vigilancia de Microorganismos Resistentes”sentencia Jesús Oteo.

Artículo de referencia:

El estudio multicéntrico CARB-ES-19 de Klebsiella pneumoniae y Escherichia coli productoras de carbapenemasas de todas las provincias españolas revela la propagación interregional de clones de alto riesgo como ST307/OXA-48 y ST512/KPC-3 Javier E. Cañada-García, Zaira Moure, Pedro J. Sola-Campoy, Mercedes Delgado-Valverde, María E. Cano, Desirèe Gijón, Mónica González, Irene Gracia-Ahufinger, Nieves Larrosa, Xavier Mulet, Cristina Pitart, Alba Rivera, Germán Bou, Jorge Calvo, Rafael Cantón, Juan José González-López, Luis Martínez-Martínez, Ferrán Navarro, Antonio Oliver, Zaira R. Palacios-Baena, Álvaro Pascual, Guillermo Ruiz-Carrascoso, Jordi Vila, Belén Aracil, María Pérez- Vázquez, Jesús Oteo-Iglesias y el Grupo de Estudio GEMARA/GEIRAS-SEIMC/REIPI CARB-ES-19 https://doi.org/10.3389/fmicb.2022.918362

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